高允茲（17世紀—1653年），字不疑，山東萊州府膠州人，明朝、南明政治人物。

崇禎三年（1630年），高允茲舉庚午科山東鄉(xiāng)試，崇禎七年（1634年）登甲戌科進士，授完縣知縣，因守禦有功，升河南道監(jiān)察御史，巡按南直隸蘇松等處，因父母去世回鄉(xiāng)。

服闕，改任云南道御史。

弘光時，不依附張捷，大悲案爆發(fā)時要求立刻處決大悲，不令人民生疑；外任湖西道副使后不久南京就失陷，和譚國禎訓練鄉(xiāng)兵自保，因兵變、國禎死而作罷。

隆武年間他巡按下游，上疏閩南抽稅害處，隆武帝下令嚴厲執(zhí)法，同時請求免去汀州借助得免。

福京失陷后，降清，順治十年（1653年）海時行反正明朝，他大罵對方而死。

雍正年間入祀昭忠祠，至嘉慶六年（1801年）獲世襲恩騎尉。