林有孚（1481年—？

），字以吉，號石崖，福建興化府莆田縣人，軍籍。

正德五年（1510年）庚午科福建鄉(xiāng)試第六名。

正德六年（1511年）聯(lián)捷辛未科第二甲第八十名進(jìn)士。

本年十二月擢授山東道試監(jiān)察御史，十二年六月提調(diào)南直隸學(xué)校。

嘉靖三年（1524年）九月復(fù)除御史原職，命提督南直隸學(xué)校。

五年十月升南京大理寺右寺丞，八年四月升大理寺右少卿，九年九月升都察院右僉都御史、巡撫保定等處兼提督紫荊諸關(guān)，順天、河間、真定、保定各處滹沱河連年水溢為患，御史徐汝圭劾奏巡撫林有孚坐視民瘼，不行修治賑恤，并發(fā)其縱容妾黨夤緣奸利等事，改官右僉都御史總督南京糧儲。

嘉靖十一年（1532年），御史傅漢臣彈劾其私屬故吏臨清州知州劉守臣，強買民間女為妾，被逮下詔獄，獄中上書自白，并論漢臣挾私彈劾之故，次年黜為民。